使用可能です。
なお運営されているデータベースのバージョンによってコマンドが異なります。

※ データベースのバージョンを選択できないサーバに関しましてはMySQL5系と同じコマンドとなります。

MySQL5系	MySQL4系
mysql	mysql-4.0
mysqldump	mysqldump-4.0
mysqlimport	mysqlimport-4.0
mysqlshow	mysqlshow-4.0
mysql_config	mysql_config-4.0